Как следует правильно писать "в оглавлении" или "в оглавление"?
Какое окончание следует писать "и" или "е"?

Оба варианта написания имени существительного с предлогом "в" верны в орфографическом и грамматическом  плане, но каждый зависит от речевой ситуации/контекста.
Дело в том, что предлог "в" употребляется и с винительным, и с предложным падежом.
В оглавление - винительный падеж, указывающий в данном случае на предмет, внутрь которого направляется действие, поэтому сущ-е среднего рода на "-ие" имеет окончание   [-э], на письме обозначаемое буквой  "-е", напр., В оглавление (во что? куда?) книги внесены поправки. В оглавлении - предложный падеж, указывает на ограниченную область, место действия, а сущ-е среднего рода на "-ие" имеют в этом падеже окончание "-и"; напр., В оглавлении (в чём? где?) книги обнаружена неточность.