Короче, что означает то и другое, и в каких случаях имеет смысл употреблять эти понятия вместе и отдельно.

Фактический - это значит реально, в действительности существующий, то, что есть -- о предметах, событиях, характеристиках, о положении дел, состоянии.
Фактологический - основанный на фактах, на конкретном материале, имеющий дело с фактами: ф-ое описание, ф-ое документирование(-основанное на фактах).
Что значит "употреблять эти понятия вместе и отдельно" я не понимаю. Употреблять в соотв-ии со смыслом да и всё.