Работаю я над одной книгой, и вот возник вопрос по поводу написания заглавных букв в таких названиях, как: "остров богов", "военная академия", "академия семи крыльев", "матушка зима" (имя духа), отряд "дублет".
В книге это писалось так: "Остров богов", "Военная академия", "Академия семи крыльев", "Матушка зима", отряд "Дублет". Все верно?

Употребление большой/прописной/ буквы в орфографии современного русского языка подчиняется особым правилам (в начале предложения - само собой разумеющееся).
Поговорим о каждом представленном в вопросе случае.
Следую алфавитному порядку.
1.Академия семи крыльев - собственное наименование, состоит из трёх слов, с прописной пишем только первое, разумеется, без кавычек.
2.В/в/оенная академия - существуют 2 варианта, первый - как и выше сказано, второй - оба слова со строчной/маленькой, если речь идёт не о наименовании учебного заведения, кавычек нет в обоих случаях,
3.матушка Зима - сочетание однородного понятия (со строчной) с именем собственным/сказочны�м (с прописной), но если просто художественная характеристика времени года, то оба слова с маленькой буквы и через дефис - матушка-зима, оба варианта без кавычек,
4.Остров богов - тот же случай, что и под номером 1,
5.отряд "Дублет" - очевидно, второе слово - название, пишем с прописной и в кавычках, родовое понятие (отряд) со строчной и без кавычек.
Итак, одно сочетание неверное, у меня это номер 3, добавим ещё неуместное использование кавычек в 4-х случаях (верно под №5).
                                                                              

Все верно, но вроде бы  "Академия Семи Крыльев" все буквы будут заглавными.