И когда последним, медвежковато шагая, подошел Ипполит Шалый, и, сдержанно посмеиваясь, смущенный всеобщим вниманием, издали протянул черную, раздавленную работой огромную руку, Нагульнов шагнул ему навстречу, крепко обнял широкие сутулые плечи старого кузнеца.
Почему здесь подошел и протянул не однородные сказуемые? Ведь ставится же запятая перед союзом и .

В этом предложении есть пунктуационная ошибка: после фамилии персонажа (а это подлежащее) перед союзом и запятая не нужна, т.к. здесь этот одиночный союз как раз и связывает однородные сказуемые "подошёл" и "протянул".
В целом это сложноподчинённое предложение, состоящее из двух частей: 1) - придаточное (союзная группа "и когда", 2) - главное. Обе части двусоставные (есть и подлежащее, и сказуемое).
Нас интересует первая часть, поэтому говорю только о ней.
В ней есть осложнения:
обстоятельства, выраженные деепричастными оборотами, обособленные с обеих сторон, - медвежковато шагая, сдержанно посмеиваясь,обособленные определения, выраженные причастными оборотами - смущённый всеобщим вниманием, раздавленную работой,однородные сказуемые - подошел, протянул, согласующиеся с подлежащим Ипполит Шалый. Они связаны одиночным соединительным союзом и.                                                                              

Просмотрела несколько текстов "Поднятой целины" в интернете. [Очень жаль, что бумажная книга из моей домашней  библиотеки давно канула в Лету].
В них нет запятой перед и. В некоторых нет и самого союза, но не суть. Интернетный материал зачастую неряшливо оформлен.
Я тоже считаю, что эта запятая здесь лишняя.

Совершенно согласна с предыдущими комментаторами. В приведённом предложении "подошёл" и "протянул" - однородные сказуемые, запятая ПЕРЕД "и" не нужна.