и пристойным, и непристойным, даже матерным. Я имею ввиду ту часть тела на которой человек сидит - попа. Почему название этой же части тела но на букву "Ж", сразу становится непристойным?

На самом деле такие слова, как попа или зад, тоже не вполне пристойные. В официально-деловой и литературной речи они не используются. Хотя и менее грубые, так как в силу отсутствия шипящих звуков менее эмоциональные и экспрессивные.
Что касается того, почему названия некоторых частей тела и вполне естественных физиологических актов, в том числе связанных с появлением потомства, нельзя употреблять в приличном обществе, вплоть до крупного штрафа или административного ареста, это история очень давняя. Подобные нормы есть во всех языках. И связаны они изначально с христианской религией. Именно названия тех частей тела, процессов и особенностей поведения, которые нельзя выставлять на всеобщее обозрение в приличном обществе, нельзя и употреблять вслух, кроме узкого круга посвящённых. В то же время, как перед врачом можно не стесняться, так и те же самые названия в виде медицинских терминов вполне допустимы. А ругательных и оскорбительных слов гораздо больше.